More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5644 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5644  ABC-1 domain protein  100 
 
 
646 aa  1259    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588147  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  46.67 
 
 
652 aa  524  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1668  ABC-1 domain protein  43.17 
 
 
657 aa  352  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.670812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2127  ABC1 family protein  31.95 
 
 
648 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3188  ABC1 family protein  32.21 
 
 
648 aa  352  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2198  ABC1 family protein  32.25 
 
 
648 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2150  ABC1 family protein  31.64 
 
 
648 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  31.73 
 
 
558 aa  261  4e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.42 
 
 
544 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  32.41 
 
 
558 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  35.04 
 
 
557 aa  244  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.61 
 
 
558 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4857  ABC-1 domain protein  34.7 
 
 
646 aa  243  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.982247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.51 
 
 
558 aa  237  4e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  33.05 
 
 
558 aa  236  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.62 
 
 
561 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  28.16 
 
 
559 aa  232  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 
565 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  29.77 
 
 
556 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  33.46 
 
 
565 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  37.66 
 
 
556 aa  230  7e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  32.49 
 
 
551 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  27.74 
 
 
558 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  35.37 
 
 
568 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  29.48 
 
 
557 aa  220  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1047  protein kinase  29.57 
 
 
525 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  32.36 
 
 
563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.28 
 
 
573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  30.18 
 
 
591 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  31.62 
 
 
562 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.11 
 
 
558 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  32.1 
 
 
559 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  30.27 
 
 
565 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  28.01 
 
 
537 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.84 
 
 
555 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  29.89 
 
 
560 aa  208  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.75 
 
 
561 aa  208  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  32.88 
 
 
581 aa  207  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  34.93 
 
 
543 aa  207  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  27.65 
 
 
537 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  33.68 
 
 
552 aa  205  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  34.72 
 
 
543 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  34.72 
 
 
556 aa  206  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10840  predicted unusual protein kinase  31.44 
 
 
550 aa  205  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  30.38 
 
 
560 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  32.43 
 
 
581 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4049  hypothetical protein  29.29 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240057  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  31.01 
 
 
582 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  29.45 
 
 
561 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.38 
 
 
554 aa  202  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  34.32 
 
 
546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  32.81 
 
 
585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  31.79 
 
 
547 aa  200  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  34.79 
 
 
544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  34.98 
 
 
544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0243  hypothetical protein  32.65 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.469557  normal  0.547936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3335  ABC-1 domain protein  30.22 
 
 
549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0521538  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.33 
 
 
559 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.84 
 
 
584 aa  198  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  29.78 
 
 
563 aa  198  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  30.61 
 
 
560 aa  198  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  34.73 
 
 
551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.14 
 
 
561 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1228  unusual protein kinase  32.13 
 
 
606 aa  197  5.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.99408  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  25.75 
 
 
559 aa  197  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.69 
 
 
559 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2767  ABC-1 domain protein  30 
 
 
549 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0222  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 
571 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.164391  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  27.93 
 
 
564 aa  195  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2681  hypothetical protein  28.44 
 
 
547 aa  195  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.259023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.13 
 
 
555 aa  196  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.65 
 
 
501 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.86 
 
 
549 aa  193  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2690  ABC-1 domain protein  32.04 
 
 
582 aa  192  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.066858  normal  0.0662715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1468  hypothetical protein  29.89 
 
 
562 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.954776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3381  hypothetical protein  31 
 
 
578 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  32.06 
 
 
582 aa  191  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1617  ABC-1 domain protein  28.2 
 
 
547 aa  191  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  33.41 
 
 
560 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  32.85 
 
 
557 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  34.36 
 
 
582 aa  191  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  30.27 
 
 
552 aa  190  8e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  30.53 
 
 
557 aa  190  8e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1760  ABC-1 domain-containing protein  27.74 
 
 
547 aa  190  8e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1941  ABC-1 domain protein  30.43 
 
 
549 aa  190  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  32.15 
 
 
582 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  32.43 
 
 
557 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.18 
 
 
559 aa  189  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1211  ABC-1 domain protein  32.49 
 
 
545 aa  189  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0155  ABC-1 domain protein  29.94 
 
 
584 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00185412  normal  0.0113585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  33.41 
 
 
553 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3756  ABC-1 domain protein  32.64 
 
 
563 aa  187  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0159  ABC-1 domain protein  29.74 
 
 
561 aa  187  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02381  putative kinase  27.27 
 
 
555 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.802769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.22 
 
 
557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34.13 
 
 
550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1817  hypothetical protein  28.01 
 
 
571 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.457399  normal  0.0626146 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4048  hypothetical protein  34.08 
 
 
556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0950  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.19 
 
 
578 aa  185  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.467498  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  32.21 
 
 
583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>