98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1316 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  822    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  50.77 
 
 
393 aa  408  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  40.26 
 
 
388 aa  265  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  38.13 
 
 
360 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
374 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
374 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
378 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  32.47 
 
 
377 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  30.81 
 
 
382 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  30.55 
 
 
382 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  33.84 
 
 
377 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  30.65 
 
 
382 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 
378 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  32.28 
 
 
369 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  30.67 
 
 
369 aa  192  7e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.26 
 
 
381 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  25.13 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  22.56 
 
 
399 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  26.32 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
378 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.03 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  20.09 
 
 
393 aa  49.7  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  20.09 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.03 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  25.82 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 
430 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
379 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
422 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  27.61 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0890  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.77 
 
 
502 aa  47.8  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  22.97 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  28.57 
 
 
423 aa  47.4  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  23.12 
 
 
397 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  33.66 
 
 
668 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  26.42 
 
 
650 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.42 
 
 
649 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  33.67 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.67 
 
 
648 aa  46.2  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.67 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  28.83 
 
 
653 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  33.67 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.67 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.67 
 
 
648 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
648 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  20.49 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.44 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 
452 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  31.03 
 
 
387 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  23.54 
 
 
402 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  33.67 
 
 
648 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  22.75 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.4 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  43.14 
 
 
649 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01530  hypothetical protein  26.09 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0600  DevC protein  24.16 
 
 
388 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  47.83 
 
 
648 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1449  hypothetical protein  24.28 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  23.7 
 
 
403 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.2 
 
 
385 aa  45.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0065  ABC transporter permease  30 
 
 
772 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.43 
 
 
411 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  26.13 
 
 
401 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  26.62 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  24.53 
 
 
848 aa  43.9  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  40 
 
 
681 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  40 
 
 
687 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.26 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  40 
 
 
681 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 
386 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  25.78 
 
 
851 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  21.8 
 
 
404 aa  43.5  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.17 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.03 
 
 
398 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  39.22 
 
 
373 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.69 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.46 
 
 
397 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  21.53 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  38 
 
 
651 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.18 
 
 
649 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.69 
 
 
410 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.3 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.3 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  27.69 
 
 
779 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.19 
 
 
862 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  28.3 
 
 
653 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.46 
 
 
849 aa  42.7  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>