40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0469 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
382 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  95.03 
 
 
382 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  97.91 
 
 
382 aa  692    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  48.01 
 
 
377 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  48.68 
 
 
378 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  48.41 
 
 
378 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 
360 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  50.4 
 
 
377 aa  348  6e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  44.77 
 
 
374 aa  331  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  45.31 
 
 
374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  30.55 
 
 
409 aa  222  9e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
393 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  26.03 
 
 
388 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 
369 aa  146  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  21.22 
 
 
369 aa  122  9e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30.2 
 
 
836 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.84 
 
 
383 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.4 
 
 
393 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.4 
 
 
376 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 
379 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  22.26 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.26 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.61 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  22.18 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.58 
 
 
423 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.81 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  25.44 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1581  hypothetical protein  29.23 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000122912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.27 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1201  putative permease  29.77 
 
 
431 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0390517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.6 
 
 
434 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.3 
 
 
438 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.311939  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.93 
 
 
382 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.78 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 
414 aa  42.7  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.53 
 
 
393 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 
386 aa  43.1  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.59 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.75 
 
 
434 aa  42.7  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>