50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3588 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  91.71 
 
 		 374 aa  679    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 374 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  54.69 
 
 		 378 aa  424  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  55.71 
 
 		 360 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  58.18 
 
 		 377 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  50.94 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  51.21 
 
 		 378 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  45.58 
 
 		 382 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  44.77 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  45.04 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  32.99 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  29.77 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  24.48 
 
 		 369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  29.03 
 
 		 409 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  19.58 
 
 		 1132 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.03 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.03 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 422 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.65 
 
 		 398 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  26.96 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.96 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  28.65 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  22.77 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  33.04 
 
 		 418 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  23.19 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  22.8 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.37 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  26.06 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  28.69 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  24.66 
 
 		 779 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.05 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.94 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  24.84 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  26.09 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  21.89 
 
 		 401 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  29.57 
 
 		 422 aa  43.5  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  30.43 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  23.98 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.76 
 
 		 399 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  25.51 
 
 		 405 aa  43.1  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>