43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0440 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  95.03 
 
 
382 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  100 
 
 
382 aa  733    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  95.29 
 
 
382 aa  680    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  48.54 
 
 
377 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  48.15 
 
 
378 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  49.72 
 
 
360 aa  364  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  48.93 
 
 
378 aa  362  6e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  50.4 
 
 
377 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  45.04 
 
 
374 aa  334  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  45.58 
 
 
374 aa  328  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  30.73 
 
 
409 aa  224  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  30.93 
 
 
393 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  27.32 
 
 
388 aa  176  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 
369 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  21.22 
 
 
369 aa  124  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  30.98 
 
 
836 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.28 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  23.32 
 
 
422 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.05 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 
376 aa  52.8  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.24 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.04 
 
 
438 aa  50.4  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.311939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.51 
 
 
434 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  24.48 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.51 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
379 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0919  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.13 
 
 
436 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 
398 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  25.59 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  25.44 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.46 
 
 
382 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.13 
 
 
389 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  18.93 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.83 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  22.06 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  23.44 
 
 
379 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  19.48 
 
 
416 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1581  hypothetical protein  28.21 
 
 
384 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000122912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  20.34 
 
 
393 aa  43.1  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.78 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  33.64 
 
 
404 aa  42.7  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>