51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3638 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 374 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  91.71 
 
 		 374 aa  702    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  54.42 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  56.42 
 
 		 360 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  57.37 
 
 		 377 aa  401  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  51.74 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  52.01 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  46.11 
 
 		 382 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  45.31 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  45.58 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  33.42 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  29.56 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  25.13 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.48 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  28.11 
 
 		 409 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  19.58 
 
 		 1132 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  21.84 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  28.41 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  28.41 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  28.41 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  22.64 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  23.53 
 
 		 400 aa  47  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  21.79 
 
 		 393 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 		 414 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 386 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  21.79 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  31.78 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.19 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  27.84 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  24.64 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  26.32 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 735 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  28.69 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  27.93 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.01 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.17 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 443 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  30.43 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1545  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.63 
 
 		 407 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0135691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  32.11 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  23.81 
 
 		 779 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  25.87 
 
 		 399 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  23.66 
 
 		 779 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.17 
 
 		 423 aa  42.7  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  31.3 
 
 		 418 aa  42.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>