81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0682 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 378 aa  758    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  73.02 
 
 		 377 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  57.94 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  53.48 
 
 		 378 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  51.21 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  53.05 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  52.01 
 
 		 374 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  49.21 
 
 		 382 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  48.41 
 
 		 382 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  48.93 
 
 		 382 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  32.81 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  25.58 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  26.9 
 
 		 369 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1813  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0198484  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2785  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  27.65 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0560328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2477  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  26.79 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.312785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2207  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25.8 
 
 		 399 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.014511  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1294  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.37 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00760264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2151  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.37 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0495834  hitchhiker  0.000401366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2485  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25.8 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000207153  normal  0.0266148 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1631  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.37 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0156966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1332  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.37 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.285275  hitchhiker  0.00268115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1317  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.12 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131027  hitchhiker  0.00016263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1967  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.12 
 
 		 399 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1238  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000418964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01112  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.822017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2010  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366068  normal  0.0307144 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1496  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000126096  normal  0.823464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01120  hypothetical protein  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.677381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2531  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.44 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000306464  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  27.8 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1648  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  24.83 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2001  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  23.86 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22558  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1632  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.55 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000222973  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1618  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  24.4 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.86 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.9 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2203  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  23.36 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  20.9 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1727  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.45 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0426  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolC  22.73 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.43 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.57 
 
 		 423 aa  46.6  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1707  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  24.65 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.64 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.56 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.24 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1600  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  24.65 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000642321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2831  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.43 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0414508  hitchhiker  0.00948545 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2863  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  25 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0147192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.43 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.64 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  21.63 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.4 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1732  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.77 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000230733  normal  0.778941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  29.25 
 
 		 643 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  25.44 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1812  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.77 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0248293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2287  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.77 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3421  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.7 
 
 		 417 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.176273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  29.93 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.29 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  32.63 
 
 		 399 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.96 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 422 aa  43.1  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003992  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.93 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  24.66 
 
 		 779 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.31 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  28.57 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  30.3 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  27.54 
 
 		 422 aa  43.1  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.08 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  28.79 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.9 
 
 		 439 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>