34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1880 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  100 
 
 		 369 aa  739    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  47.7 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  30.67 
 
 		 409 aa  182  8.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 378 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  24.73 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  23.58 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  25.81 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  25.91 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 382 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  21.16 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  21.01 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  23.88 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.17 
 
 		 419 aa  49.3  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0922  hypothetical protein  22.94 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.696893 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.42 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 855 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  20.06 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.42 
 
 		 376 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  24.91 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1376  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.59 
 
 		 443 aa  43.9  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0730301  normal  0.0697431 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  22.11 
 
 		 422 aa  43.9  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  26.62 
 
 		 1130 aa  43.9  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  22.16 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  20.45 
 
 		 378 aa  43.1  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  22.81 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  21.41 
 
 		 421 aa  43.1  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  19.75 
 
 		 849 aa  43.1  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  23.18 
 
 		 841 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.85 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>