56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2173 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
393 aa  782    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  50.77 
 
 
409 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  37.28 
 
 
388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 
374 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 
378 aa  229  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 
374 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  31.93 
 
 
360 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  31.27 
 
 
382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  210  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 
369 aa  209  5e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
382 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  30.49 
 
 
382 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  31.79 
 
 
378 aa  202  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  30.49 
 
 
377 aa  186  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  28.9 
 
 
369 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  24.57 
 
 
376 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.57 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  23.76 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 
422 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1758  putative ABC transport system permease protein  27.63 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  20.81 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  23.17 
 
 
422 aa  54.7  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  22.7 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0385  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 
422 aa  53.5  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0295868  normal  0.0668384 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  22.97 
 
 
422 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 
852 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  22.22 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2091  hypothetical protein  24.64 
 
 
843 aa  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597991  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0832  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 
383 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0898  hypothetical protein  25.12 
 
 
851 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 
421 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  21.76 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2242  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 
844 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.805016  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  21.76 
 
 
399 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.44 
 
 
399 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  28.65 
 
 
421 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  22.52 
 
 
393 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  25.21 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  22.66 
 
 
402 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
844 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  29.27 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0934  hypothetical protein  23.7 
 
 
869 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  25 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  21.97 
 
 
397 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  27.93 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  25.65 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  22.81 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.36 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1059  hypothetical protein  25.95 
 
 
401 aa  43.1  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  25.14 
 
 
388 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
386 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>