152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0985 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  803    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  35.32 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  36.16 
 
 
402 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  31.34 
 
 
401 aa  216  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  32.1 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  29.82 
 
 
399 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
401 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.46 
 
 
389 aa  90.5  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  26.43 
 
 
389 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  23.43 
 
 
406 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.43 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.28 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.39 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  23 
 
 
441 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  22.82 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  25.28 
 
 
411 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.15 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  24.11 
 
 
402 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  21.15 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 
803 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.22 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 
404 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.27 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  23.74 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.39 
 
 
423 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  31.95 
 
 
1130 aa  55.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.65 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  30.23 
 
 
849 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 
406 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.06 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  23.36 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  26.17 
 
 
421 aa  53.1  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3628  lipoprotein ABC transporter, permease  22.74 
 
 
407 aa  53.1  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  24.17 
 
 
411 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  32.84 
 
 
903 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  29.69 
 
 
779 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.29 
 
 
414 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  28.1 
 
 
484 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.46 
 
 
1207 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.39 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  23.49 
 
 
408 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  28.66 
 
 
1090 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  24.46 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  28.74 
 
 
885 aa  50.8  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  30.77 
 
 
851 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.29 
 
 
414 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  31.15 
 
 
415 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2239  hypothetical protein  19.92 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2211  hypothetical protein  19.92 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  31.01 
 
 
779 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2039  lipoprotein releasing system, permease protein, putative  27.27 
 
 
448 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.53 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1848  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein lolC  26.64 
 
 
408 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  20.78 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  24.2 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  24.2 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.37 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  31.18 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1172  hypothetical protein  26.77 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.811574  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1518  permease, putative  22.7 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000418137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1033  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  22.34 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
374 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1577  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.340093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  22.34 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  35.05 
 
 
857 aa  47  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  24.91 
 
 
425 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  24.03 
 
 
384 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02835  hypothetical protein  30.47 
 
 
427 aa  47  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  21.64 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  24.23 
 
 
411 aa  46.6  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 
830 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.61 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
808 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.71 
 
 
888 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  21.1 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.63 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.15 
 
 
416 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  24.42 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.51 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  25.59 
 
 
393 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.23 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.105079  normal  0.498084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.09 
 
 
863 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  24.59 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.35 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  26.26 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  19.9 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0109  protein of unknown function DUF214  35.96 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  24.02 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
845 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  22.44 
 
 
427 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2003  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  24.15 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0260565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0747  lipoprotein releasing system  20.76 
 
 
428 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  21.98 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.24 
 
 
423 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0917  hypothetical protein  22.38 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2173  hypothetical protein  22 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 
849 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>