More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1426 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1426  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  795    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.407629  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2199  hypothetical protein  53.79 
 
 		 400 aa  401  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.748449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1654  hypothetical protein  43.15 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.498405  normal  0.951827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0759  hypothetical protein  41.67 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00207585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  35.57 
 
 		 400 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0985  hypothetical protein  36.16 
 
 		 402 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2654  ABC transporter, permease protein  33.67 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0708496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  22.6 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.02 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.02 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.28 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1839  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  0.633197 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  21.66 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0832  protein of unknown function DUF214  21.45 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  23.24 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  21.58 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  26.02 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  26.32 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  24.18 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1470  hypothetical protein  22.95 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.901126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3882  hypothetical protein  22.99 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00664536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  24.21 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.1 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.93 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  23.8 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.82 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  21.37 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  22.71 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  24.36 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.09 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  21.43 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.41 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.2 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  23.75 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1848  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein lolC  21.17 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.517153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  22.7 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.2 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  22.67 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  20.82 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6489  protein of unknown function DUF214  22.95 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1541  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.43 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.470748  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  22.68 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  19.93 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.24 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.85 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.41 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1740  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.12 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170655 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1446  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.97 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  26.05 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  20.75 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  23.6 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.25 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2826  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.663211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  29.93 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 830 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.58 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.64 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  21.17 
 
 		 409 aa  57  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.03 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  21.58 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  23.06 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.45 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3827  hypothetical protein  21.45 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.53 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  20.8 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  22.74 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  20.51 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  24.06 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.73 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.03 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  23.99 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  22.83 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.26 
 
 		 851 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  20.65 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  24.02 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  24.65 
 
 		 488 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 378 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.6 
 
 		 885 aa  53.5  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2993  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 375 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  21.39 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  22.81 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1332  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.38 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.803281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  22.37 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0365  hypothetical protein  21.83 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  23.8 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>