34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1260 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 360 aa  724    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  59.72 
 
 		 378 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  58.22 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  55.71 
 
 		 374 aa  411  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  57.94 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  57.94 
 
 		 377 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  56.42 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  51.12 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  49.72 
 
 		 382 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  49.72 
 
 		 382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  38.13 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  29.65 
 
 		 388 aa  169  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  23.58 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.12 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  24.9 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  31.36 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0937  hypothetical protein  26.39 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.391687  hitchhiker  0.00182616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  23.05 
 
 		 416 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 398 aa  47  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.01 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  25.7 
 
 		 400 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.6 
 
 		 426 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  22.37 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 		 422 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  24.84 
 
 		 1016 aa  43.9  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2154  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.4 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0219351 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  30.17 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  29.46 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.97 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>