34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0695 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 369 aa  750    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  47.7 
 
 		 369 aa  344  1e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  32.28 
 
 		 409 aa  199  5e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  33.07 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  30.27 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  25.95 
 
 		 377 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  26.76 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  29.34 
 
 		 388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 		 374 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  26.49 
 
 		 382 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  28.92 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.03 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1740  ABC transporter membrane spanning protein  25 
 
 		 435 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.147499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2534  hypothetical protein  26.8 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176241  normal  0.761271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.489126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 		 439 aa  46.2  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  28.34 
 
 		 1130 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.08 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  21.54 
 
 		 850 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.89 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  21.54 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.4 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.55 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.6 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.96 
 
 		 413 aa  43.9  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  25.68 
 
 		 418 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.97 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.6 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  26.53 
 
 		 385 aa  43.1  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5592  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 378 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00756234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>