147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2998 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  86.24 
 
 
189 aa  345  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  77.78 
 
 
189 aa  313  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  77.78 
 
 
189 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  77.25 
 
 
189 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  77.25 
 
 
189 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  77.25 
 
 
189 aa  308  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  76.19 
 
 
189 aa  307  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  76.19 
 
 
189 aa  306  9e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  75.13 
 
 
189 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  75.13 
 
 
189 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  75.66 
 
 
189 aa  304  6e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  74.6 
 
 
189 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  70.21 
 
 
187 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  55.56 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  40.61 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  43.15 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  40.61 
 
 
196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  38.38 
 
 
193 aa  124  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  37.11 
 
 
194 aa  121  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  46.34 
 
 
196 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  36.45 
 
 
208 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  35.75 
 
 
195 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  35.08 
 
 
193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  52.48 
 
 
195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  45.45 
 
 
203 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  48.31 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 
195 aa  84.7  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  30.26 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  29.74 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  29.23 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  27.08 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  26.18 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  28.21 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  32.61 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  27.27 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  32.62 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.86 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  31.62 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  29.1 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  27.8 
 
 
223 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  34.62 
 
 
209 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  30.19 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  32.67 
 
 
213 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  29.82 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  27.17 
 
 
220 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  38.82 
 
 
240 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.96 
 
 
239 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  30.58 
 
 
214 aa  52  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.96 
 
 
239 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  34.83 
 
 
219 aa  52  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  30.93 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  27.74 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  33.63 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  27.74 
 
 
230 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  26.32 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  27.72 
 
 
224 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  34.09 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.58 
 
 
229 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.67 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  26.32 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  35.87 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  28.02 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  26.74 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  39.71 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  38.24 
 
 
220 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  31.25 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  27.01 
 
 
230 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  26.92 
 
 
203 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  35 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  23.94 
 
 
209 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  26.14 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.75 
 
 
230 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.95 
 
 
243 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 
212 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  28.3 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  27.52 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  25.46 
 
 
216 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  28.3 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 
189 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  35.11 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  28.3 
 
 
218 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  38.24 
 
 
220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.58 
 
 
228 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  28.74 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  36.76 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  36.76 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  34.48 
 
 
316 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  34.04 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  36.76 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 
212 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  47.62 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  35.23 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  25.96 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30.77 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>