155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5746 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  44.04 
 
 
194 aa  178  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  43.08 
 
 
195 aa  161  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  40.21 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  40.31 
 
 
193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  38.97 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  38.97 
 
 
196 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 
196 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  40.8 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  49.28 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  41.33 
 
 
203 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  38.34 
 
 
189 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  37.13 
 
 
208 aa  122  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  37.82 
 
 
189 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  36.79 
 
 
189 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  37.82 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.54 
 
 
204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  35.57 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  37.31 
 
 
189 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  36.79 
 
 
189 aa  118  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  36.79 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  36.27 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  36.79 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  35.75 
 
 
189 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  36.27 
 
 
189 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  35.42 
 
 
187 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  32.32 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  31.31 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  27.98 
 
 
195 aa  87.8  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  26.8 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  29.31 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  29.65 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  31.22 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  29.3 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 
211 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  31.73 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  31.3 
 
 
219 aa  62.8  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  25.66 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  31.43 
 
 
209 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  26.24 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.92 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28 
 
 
224 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  28.16 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  29.61 
 
 
212 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  25.58 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  31.71 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  26.72 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  30.89 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  30.89 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  25.45 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.51 
 
 
218 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.59 
 
 
187 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  25.49 
 
 
225 aa  51.6  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  26.54 
 
 
204 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  27.67 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  31.43 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  31.25 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  25.34 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  27.47 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  27.47 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  27.47 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  27.47 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  27.47 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  27.47 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  25.71 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  27.27 
 
 
214 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.79 
 
 
221 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  27.78 
 
 
254 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.17 
 
 
183 aa  48.9  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  27.78 
 
 
242 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  30.53 
 
 
240 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  28.87 
 
 
183 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  28.43 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  28.43 
 
 
230 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  33.96 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  28.43 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  51.43 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 
174 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  28.16 
 
 
231 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  28.71 
 
 
244 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  26.42 
 
 
209 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  35.09 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  24.86 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  31.63 
 
 
216 aa  45.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  54.55 
 
 
223 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  24.86 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  24.86 
 
 
231 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>