178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0200 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  447  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  53.92 
 
 		 222 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  44.05 
 
 		 223 aa  182  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  42.79 
 
 		 235 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  46.9 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  44.84 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  43.69 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  41.94 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  42.67 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  41.59 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  40.09 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  40.55 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  40.55 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  46.51 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  46.51 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  38.46 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  38.83 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  36.87 
 
 		 218 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  28.42 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  26.27 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  26.27 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  40.82 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  41.24 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  35.04 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.5 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  42.86 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  34.55 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  24.88 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  25.45 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  25.45 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  35.05 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  30.69 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  40.24 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  26.7 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  33.98 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  33.93 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  26.91 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  36.36 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25.23 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  33.03 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  33.03 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  33.68 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  33.03 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  33.68 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  35.45 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  28.95 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  33.03 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  26.03 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  33.94 
 
 		 426 aa  58.2  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  35.65 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  37.62 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  32.97 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  28.05 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.74 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  28.77 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  36.11 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  32.11 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  31.31 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  37.5 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  26.72 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  28.51 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  32.62 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  27.9 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  35.79 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  35.64 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  30.36 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  28.14 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  30.4 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  36.84 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  29.57 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  35.48 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  35.56 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  34.31 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  31.67 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  33.68 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  33.68 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  29.46 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  37.25 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  34.65 
 
 		 220 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>