198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1765 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  454  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  53.92 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  46.4 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  45.81 
 
 
223 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  46.46 
 
 
223 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  43.61 
 
 
223 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  41.23 
 
 
235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  42.92 
 
 
228 aa  168  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  41.52 
 
 
235 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  45.02 
 
 
223 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  41.78 
 
 
216 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  37.66 
 
 
236 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  40.54 
 
 
218 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  40.27 
 
 
221 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  39.65 
 
 
244 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  42.94 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  42.37 
 
 
241 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  37.05 
 
 
218 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  36.54 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  37.86 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  37.86 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  37.86 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  36.89 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  30.72 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  43.96 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  39.8 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  45.05 
 
 
213 aa  76.6  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.09 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  35.51 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  35.51 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  35.51 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  40.45 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  36.21 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  40.62 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  35.64 
 
 
400 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  41 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  41.24 
 
 
224 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  40 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  28.7 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  35.24 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.6 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  29.69 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  29.08 
 
 
426 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  36.73 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  36.73 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  36.73 
 
 
241 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  30.97 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  36.73 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  36.73 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  31.78 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  36.73 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  35.61 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  31.5 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  41.75 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  37.23 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  35 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  35.78 
 
 
382 aa  65.5  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  35.71 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  35.35 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  26.11 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.71 
 
 
224 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  32.71 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  31.37 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  36 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  27.52 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  30.32 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  37.04 
 
 
342 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  36.27 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  28.7 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  38.46 
 
 
192 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  27.95 
 
 
220 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  35.79 
 
 
243 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.63 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  27.39 
 
 
214 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  30.73 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.79 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  29.28 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  34.55 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  36.84 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  27.85 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  27.1 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  25.66 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.79 
 
 
239 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  29.63 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  33.71 
 
 
187 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  32.82 
 
 
379 aa  60.1  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  34.65 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  33.98 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  34.74 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>