More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0081 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  45.6 
 
 		 237 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.83 
 
 		 218 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  41.28 
 
 		 241 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  40.37 
 
 		 241 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  37.21 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  34.19 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  37.07 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  42 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.44 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  39.37 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  41.94 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  38.61 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  34.09 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  35.96 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.53 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  38.61 
 
 		 244 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  30.17 
 
 		 228 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  38.21 
 
 		 234 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  36.27 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  34.31 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  31.53 
 
 		 482 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  31.73 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  40.59 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  43 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  45.56 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  35.29 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  37.86 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  32.99 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.58 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  29.66 
 
 		 230 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  30.97 
 
 		 479 aa  72  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.91 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.91 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.31 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  31.43 
 
 		 236 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.31 
 
 		 239 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  32.74 
 
 		 480 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  34.04 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  31.93 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  32.99 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  34.51 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  29.57 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  34.51 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30.08 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  31.06 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  29.46 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  33.93 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  44.21 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  34.62 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  30.43 
 
 		 241 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  34.29 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  34.48 
 
 		 383 aa  67.4  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  34.95 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  32.43 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  40.62 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  33.93 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  33.93 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  35.04 
 
 		 316 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  31.01 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  31.01 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  31.01 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  34.82 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  34.82 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  33.04 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  30.95 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  28.7 
 
 		 426 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  30.63 
 
 		 484 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  30.69 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  28.83 
 
 		 717 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.35 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  32.04 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  36.19 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  27.93 
 
 		 480 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.63 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.1 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  28.32 
 
 		 714 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>