194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3166 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  50.68 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  45.98 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  43.64 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  40.87 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  40.87 
 
 		 239 aa  147  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  39.91 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  39.91 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  36.94 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  39.27 
 
 		 220 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  38.33 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  38.71 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  39.27 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  37.16 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  36.24 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  39.64 
 
 		 220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  39.19 
 
 		 220 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  42.34 
 
 		 224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  35.09 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  38.29 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  38.29 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  41.26 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  38.12 
 
 		 220 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  38.01 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  38.01 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  37.08 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  36.32 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  37.73 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  46.92 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  46.92 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  46.92 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  40.23 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  35.42 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  46.15 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  39.73 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  28.7 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  41.24 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  26.5 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  38.78 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  26.67 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  40.78 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  36.36 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  29.06 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  26.25 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.03 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  29.5 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  42.86 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  30.81 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  35.79 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  40.82 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  34.74 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  35.19 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  35.05 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  29.78 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  40.86 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  29.79 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  36.96 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  34.44 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  32 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  24.86 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  32.65 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  37.63 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  32.65 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.48 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.65 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  37.08 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.48 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.71 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  30.1 
 
 		 400 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  36.26 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  39.13 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  27.16 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  29.11 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  36.26 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  31.14 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  27.12 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  27.04 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  39.56 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  27.54 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  28.91 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  30.58 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  31.9 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  31.87 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>