68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2840 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  98.01 
 
 		 201 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  86.57 
 
 		 201 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  76.53 
 
 		 201 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  51.28 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  51.03 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  51.12 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  45.69 
 
 		 195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.84 
 
 		 203 aa  91.7  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  31.31 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  32.14 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  35.5 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  30.93 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  36.5 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  37.81 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  32.99 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  30.15 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  30.26 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  33.17 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  30.85 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  33.17 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  30.46 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  32.66 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  32.66 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  31.66 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  31.98 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  29.9 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  29.9 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  31.53 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  29.53 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  29.6 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  27.12 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  32.87 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  31.98 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  37.61 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  26.61 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  36.26 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  33.64 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.02 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  25.35 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  28.48 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  22.07 
 
 		 216 aa  45.4  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  31.31 
 
 		 223 aa  45.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  31 
 
 		 241 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  31.96 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  25.34 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.88 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  30 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  29.3 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  24.54 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  30.34 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  32.41 
 
 		 234 aa  42.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  29.7 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  27.45 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  26.5 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  30 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  35.19 
 
 		 212 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  27.05 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>