109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2668 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
168 aa  324  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  50.31 
 
 
170 aa  156  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  52.2 
 
 
174 aa  152  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  48.12 
 
 
189 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  48.15 
 
 
180 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  30.49 
 
 
203 aa  57.4  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  31.35 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  32.77 
 
 
244 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  33.65 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.41 
 
 
229 aa  55.1  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  38.38 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  31.36 
 
 
215 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
241 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  37.76 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  33.64 
 
 
222 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.04 
 
 
237 aa  52.4  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.07 
 
 
228 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  36.45 
 
 
207 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  34.4 
 
 
226 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  30.36 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  30.36 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  38.89 
 
 
228 aa  51.2  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
209 aa  51.2  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  29.75 
 
 
205 aa  50.8  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  33 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  32.08 
 
 
217 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  32.69 
 
 
216 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.37 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.98 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
243 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.04 
 
 
213 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  37.17 
 
 
219 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.66 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.66 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.54 
 
 
228 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  34.69 
 
 
236 aa  48.5  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  27.33 
 
 
227 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  26.78 
 
 
230 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  33.01 
 
 
188 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  32.14 
 
 
241 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  31.55 
 
 
241 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  32.2 
 
 
225 aa  47.4  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  30.84 
 
 
185 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  26.83 
 
 
224 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  33.64 
 
 
214 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.93 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  35.14 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  25.31 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  29.84 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  27.47 
 
 
224 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  36.45 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  36.45 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
213 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  36.45 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  31.31 
 
 
184 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.04 
 
 
209 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  33.03 
 
 
218 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  30.84 
 
 
235 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
231 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  33.93 
 
 
195 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  33.67 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  32.14 
 
 
195 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  33.67 
 
 
201 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.36 
 
 
231 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  36.56 
 
 
223 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  32.04 
 
 
196 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  31.63 
 
 
220 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  25.27 
 
 
223 aa  44.7  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  32.22 
 
 
234 aa  44.3  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  31 
 
 
216 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  29.06 
 
 
239 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  29.06 
 
 
239 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  33.98 
 
 
214 aa  44.7  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  35.56 
 
 
201 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  28.07 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  21.2 
 
 
236 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  26.72 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  31.78 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  32.65 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  33.05 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  31.43 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  30.61 
 
 
220 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  31.13 
 
 
231 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  35 
 
 
219 aa  42  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  21.05 
 
 
227 aa  41.6  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  31.63 
 
 
220 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  32.65 
 
 
220 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  31.63 
 
 
241 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  31.31 
 
 
218 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>