205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3087 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  37.31 
 
 		 205 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  35.57 
 
 		 185 aa  87.8  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.85 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  30.56 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  32.85 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  40.54 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  35.45 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  34.97 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  39.8 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  30.64 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  32.24 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  31.39 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  32.45 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  27.35 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  29.21 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  30.43 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  31.45 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  29.52 
 
 		 426 aa  62  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  34.34 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  34.34 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  31.45 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  34.58 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  34.91 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  28.97 
 
 		 472 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  32.06 
 
 		 713 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  32.17 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  27.51 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  32.48 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  33.02 
 
 		 380 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  30.48 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  26.01 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  31.93 
 
 		 721 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  26.46 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  34.02 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1348  hypothetical protein  30.7 
 
 		 386 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  31.78 
 
 		 379 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  23.08 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  32.76 
 
 		 475 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  29.09 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  33.04 
 
 		 235 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  35 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  30.56 
 
 		 383 aa  52.4  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  32.65 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  32.02 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  33.96 
 
 		 473 aa  52  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  29.7 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  27.62 
 
 		 237 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  32.74 
 
 		 481 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  24.32 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  32.74 
 
 		 481 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  29.91 
 
 		 730 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  32.74 
 
 		 481 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.67 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  27.1 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  27.36 
 
 		 480 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0277  hypothetical protein  31.13 
 
 		 391 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  34.02 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  30.36 
 
 		 489 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  30.77 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 		 717 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0485  hypothetical protein  33.33 
 
 		 382 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.964373 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.11 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  33.67 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  30.28 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  28.1 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1412  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.41 
 
 		 484 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0326413  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  32.29 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 479 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  32.32 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  29.91 
 
 		 475 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  28.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  28.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  31.86 
 
 		 481 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.93 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  34.02 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  34.83 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  30.63 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  30.63 
 
 		 239 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  28.26 
 
 		 231 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  30.97 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  31.96 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  31.96 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.87 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  31.96 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  31.96 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  31.96 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  31.96 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  28.7 
 
 		 375 aa  48.9  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>