274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1032 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  60.29 
 
 
210 aa  265  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  56.94 
 
 
209 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  58.05 
 
 
205 aa  242  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  55.24 
 
 
209 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  40.67 
 
 
185 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  40.11 
 
 
210 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  42.37 
 
 
189 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.88 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  29.05 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 
183 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  31.03 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  42.06 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.97 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  41.28 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  40.74 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  32.24 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  30.72 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  28.29 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  36.54 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  31.3 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  39.8 
 
 
188 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  36.52 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  29 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  36.52 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  36.52 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  30.13 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  40.21 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  36.54 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  28.16 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.95 
 
 
218 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  37.11 
 
 
239 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  37.11 
 
 
239 aa  72  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  34 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  35.65 
 
 
230 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  39.13 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  38.04 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  36.63 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  36.27 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  32.69 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  38.83 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  28.1 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  33 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  34.95 
 
 
191 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34.65 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  33.67 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  35.64 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  33.67 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.95 
 
 
142 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  33.94 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  35.64 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  27.42 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.63 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.14 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.78 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  33.94 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  29.17 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  40.22 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  32.65 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  34.55 
 
 
223 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.67 
 
 
342 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  26.17 
 
 
383 aa  61.6  0.000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.77 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  33.67 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  35.96 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  33.33 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  33.96 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  31.73 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  34.74 
 
 
234 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  24.89 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  35.11 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  33.65 
 
 
189 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  33.65 
 
 
189 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  38.04 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  35.71 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  32.38 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  37.36 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  27.56 
 
 
375 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  32.69 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  26.43 
 
 
489 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.1 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  27.5 
 
 
382 aa  55.8  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  31.73 
 
 
189 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  33.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  32.63 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>