More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2283 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  80.7 
 
 
228 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  72.37 
 
 
243 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  69.43 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  69.43 
 
 
239 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  64.89 
 
 
220 aa  287  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  64.91 
 
 
220 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  64.04 
 
 
220 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  63.72 
 
 
220 aa  280  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  63.56 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  64.04 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  64.04 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  63.6 
 
 
220 aa  268  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  64.91 
 
 
220 aa  264  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  63.6 
 
 
220 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  59.82 
 
 
220 aa  246  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  59.21 
 
 
254 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  59.21 
 
 
220 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  51.13 
 
 
213 aa  187  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.33 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  37.83 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  36.1 
 
 
226 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  35.09 
 
 
224 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  34.82 
 
 
219 aa  122  7e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  40 
 
 
254 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  37.22 
 
 
234 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  39.44 
 
 
241 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  35.4 
 
 
218 aa  94.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  41.61 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  46.39 
 
 
221 aa  88.2  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  29.87 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  31.62 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  39.85 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  41.84 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.81 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  36.8 
 
 
426 aa  79  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  32.31 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  37.9 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  33.62 
 
 
219 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  30.67 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  42.57 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  29.74 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  29.34 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  28.33 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.09 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  36.54 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.62 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  39 
 
 
241 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  39.42 
 
 
383 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  39 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  40.21 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  28.7 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  28.49 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  39 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.65 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  34.13 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  38 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  34.68 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  34.68 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  34.68 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  36.5 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  26.57 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  37.86 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  30.77 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  41.67 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  39.8 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  35.5 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  37.6 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  37.6 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  37.6 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  25.93 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  33.04 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  29.15 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  39.56 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  37.5 
 
 
223 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  27.07 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  32.46 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  28.76 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  34.02 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  29.53 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  36 
 
 
187 aa  62.4  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  31.33 
 
 
236 aa  62  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  29.73 
 
 
194 aa  62  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  38.78 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  38.78 
 
 
244 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  38.78 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>