223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0981 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  98.18 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  94.09 
 
 		 220 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  96.36 
 
 		 220 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  96.36 
 
 		 220 aa  400  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  95.45 
 
 		 220 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  89.09 
 
 		 220 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  79.45 
 
 		 220 aa  360  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  79.09 
 
 		 220 aa  360  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  75.91 
 
 		 220 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  77.78 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  77.27 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  77.27 
 
 		 220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  64.04 
 
 		 239 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  64.04 
 
 		 239 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  63.6 
 
 		 228 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  64.47 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  64 
 
 		 228 aa  282  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  56.34 
 
 		 213 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.09 
 
 		 224 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  41.18 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  38.1 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.04 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  39.73 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  36.73 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  36.32 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  42.26 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  43.75 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  43.75 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  43.75 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  41.94 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  43.18 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  40.71 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  30.67 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  34.45 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  46.39 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  45.92 
 
 		 205 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  42.99 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  40.74 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  37.76 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  45 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  42 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  34.47 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  35.34 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  32.39 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  42 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  28.88 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.57 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  31.28 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.08 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  33 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.69 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 		 426 aa  67  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  39 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  33.93 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  38.61 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  33.13 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  39.8 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  38.89 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  40.82 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  41.67 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  26.99 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  36.73 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  38 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  34.82 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  33.05 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  34.02 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  39.18 
 
 		 316 aa  62  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  31.25 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  30 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  35.71 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  34.02 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  38.46 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  36.84 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  43.28 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  32.62 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>