More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2993 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.59 
 
 
189 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  34.33 
 
 
231 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  40.37 
 
 
230 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  40.25 
 
 
230 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  38.99 
 
 
230 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  38.99 
 
 
230 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  37.36 
 
 
187 aa  95.9  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  47.96 
 
 
213 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  31.88 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  29.17 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  30.72 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  30.87 
 
 
234 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  48.45 
 
 
228 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  39.17 
 
 
236 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 
237 aa  88.2  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  47.42 
 
 
220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  46.39 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  46.94 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  40.62 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  46.94 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  38.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  38.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  43.48 
 
 
220 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  37.5 
 
 
236 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  46.39 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  46.39 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  42.61 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  46.39 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  46.39 
 
 
220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  46.39 
 
 
243 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  42.99 
 
 
254 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  36.13 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  38.33 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  42.99 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  39.02 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  26.96 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  42.45 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  45.36 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  32.43 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  43.1 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  37.4 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  29.83 
 
 
222 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  27.43 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  37.19 
 
 
400 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  36.89 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  43.16 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  39.17 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 
218 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  38 
 
 
209 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  40.21 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  46.67 
 
 
224 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  42.42 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  38.32 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  29 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.62 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  24.23 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  34 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.79 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  37.86 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  37.14 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  39 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  28.5 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  26.67 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  36.89 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  35.92 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  41.84 
 
 
194 aa  71.6  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  32.11 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.89 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  39.42 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  30.7 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  34.62 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  38.78 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  31.43 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  39.08 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  31.89 
 
 
383 aa  68.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  45.35 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  39.08 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  30.27 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  34.29 
 
 
183 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>