175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0373 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  41.51 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  40.66 
 
 		 240 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  38.56 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  38.33 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  38.14 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  38.53 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  37.29 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  37.29 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  37.29 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  37.29 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  37.29 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  38.63 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  36.86 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  37.19 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  34.89 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  41.67 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  38.33 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  27.43 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  27.43 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  30.08 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  36.36 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  27.85 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  27.85 
 
 		 231 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  28.78 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  27.8 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  27.43 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  29 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  29 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  28.26 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  28.26 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.14 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.95 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  35.64 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  27.31 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  37.25 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  36 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  35.19 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  29.91 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  35.16 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.63 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  24.68 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  24.07 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  32 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  35.16 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  36.36 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  24.47 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  34 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  29.29 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  31.87 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.07 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  32.97 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  34.07 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  34.07 
 
 		 220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  23.73 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  23.92 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  24.83 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  32.97 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  32.97 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  31.63 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  23.92 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.28 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  32.97 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  26.28 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  32.97 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  32.97 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  24.31 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  28.32 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  22.11 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  31.52 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.52 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  28.04 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  32.97 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  22.32 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  32.65 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  24.18 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  30.43 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  34.04 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  32.93 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  29.63 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  30 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  30.28 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  21.74 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  22.32 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>