211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1377 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  447  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  67.43 
 
 
218 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  43.78 
 
 
218 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  48.65 
 
 
223 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  43.44 
 
 
223 aa  174  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  41.07 
 
 
223 aa  171  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  44.34 
 
 
223 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  41.94 
 
 
224 aa  166  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  46.53 
 
 
223 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  40.27 
 
 
222 aa  149  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  39.66 
 
 
235 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  38.22 
 
 
235 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  52.59 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  41.71 
 
 
241 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  41.14 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  41.71 
 
 
244 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.48 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  30.73 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  33.78 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  34.07 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  33.83 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  33.83 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  33.18 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  44.44 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  37.21 
 
 
142 aa  82  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  34.51 
 
 
216 aa  82  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  41.28 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  37.72 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  37.72 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  41.82 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  33.7 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.69 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  38.19 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  29.78 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  40 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  30.49 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  38.1 
 
 
222 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  32.11 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  27.47 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  27.81 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  29.02 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  27.78 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  32.46 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  35.14 
 
 
426 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  26.25 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  31.22 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  39.42 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  38.14 
 
 
191 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  28.8 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  29.68 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  40.21 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  29.17 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  38.32 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  37.62 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  28.32 
 
 
400 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  31.33 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  32.35 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  32.17 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  32.17 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  30 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  32.17 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  32.17 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  31.4 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  40.38 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  33.91 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  42.57 
 
 
316 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  27.78 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  29.13 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  34.23 
 
 
382 aa  63.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  30.04 
 
 
209 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  29.86 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  37.76 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  35.64 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  30.64 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  33.64 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  31.3 
 
 
241 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  36.08 
 
 
187 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  31.15 
 
 
207 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  38.71 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.11 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.28 
 
 
183 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  36.28 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  23.97 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  24.07 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.11 
 
 
239 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  36 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  36 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  35.4 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  31.34 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  36 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  31.34 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  29.11 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  31.34 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  31.34 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  31.34 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  31.34 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>