159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1898 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  40.42 
 
 
236 aa  168  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  41.51 
 
 
244 aa  167  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  40.83 
 
 
236 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  40.42 
 
 
236 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  40.42 
 
 
236 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  40.42 
 
 
236 aa  161  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  40.42 
 
 
236 aa  161  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  40.83 
 
 
236 aa  161  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  40.42 
 
 
236 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  40 
 
 
236 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  40.42 
 
 
236 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  40 
 
 
236 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  37.08 
 
 
240 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  37.7 
 
 
241 aa  148  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  31.65 
 
 
234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  30.47 
 
 
235 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  29.18 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  29.91 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  29.91 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  29.91 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  29.91 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
231 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  29.49 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  30.34 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  30.34 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  29.91 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  29.49 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  24.23 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  28.14 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  25.6 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  34.07 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  33.96 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  30.36 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  24.04 
 
 
189 aa  59.7  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  29.55 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  34.44 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  27.72 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  28.85 
 
 
142 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  34.38 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  24.51 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  29.82 
 
 
316 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.95 
 
 
233 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  28.97 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  32.32 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  24.62 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  32.04 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  33.71 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  31.93 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  31.93 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  31.43 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  30.97 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  31.96 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  35.42 
 
 
185 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  28.42 
 
 
227 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  34.07 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  31.46 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.82 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  23.9 
 
 
209 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 
342 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.08 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  30.34 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  30.34 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  23.4 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  32.22 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  33.68 
 
 
170 aa  52.4  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  30.61 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  31.11 
 
 
220 aa  52  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3087  hypothetical protein  24.32 
 
 
188 aa  51.6  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  29.21 
 
 
213 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  27.55 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  31.11 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  24.24 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  31.87 
 
 
226 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  21.31 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.58 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  22.4 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  32.58 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  28.85 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  30.77 
 
 
216 aa  50.1  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>