191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0711 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  55.72 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  55.72 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  55.12 
 
 		 231 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  54.9 
 
 		 231 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  221  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  221  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  55.72 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  55.22 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  48.29 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  49.74 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  40.41 
 
 		 241 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  39.7 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  37.7 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  36.89 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  35.92 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  35.92 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  35.44 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  35.44 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  32.37 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  31.37 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  36.67 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  28.78 
 
 		 244 aa  91.3  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  29.56 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.56 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  30.43 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  31.22 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  29.81 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  33.77 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  29.8 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  37.25 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  33.98 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.55 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.55 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  28.16 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  37.25 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  35.14 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  28.72 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  36.79 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  28.05 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  36.61 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  35 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  35.29 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  30.22 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.1 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  25.14 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  43.9 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  34.31 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  38.61 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  35.09 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30.65 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  32.67 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.98 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  40.22 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  27.75 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  23.88 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  30.36 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  35.92 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  26.83 
 
 		 234 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  32.17 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34.31 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  32.23 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  35.92 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  24.4 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  37.37 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  36.63 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  35.29 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  37.61 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.19 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  36.96 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  34.31 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>