200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5898 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  464  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  68.8 
 
 		 235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  69.6 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  67.69 
 
 		 244 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  72.08 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  71.57 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  41.88 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  40.09 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  40.34 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  39.65 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  37.66 
 
 		 222 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  38.72 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  44.44 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  33.19 
 
 		 228 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  36.48 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.6 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  36.52 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  28.09 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  31.48 
 
 		 400 aa  78.2  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  36.44 
 
 		 142 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  31.5 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  32.33 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  44 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  44 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  41.35 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  33.62 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  43 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  40.4 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  33.62 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  33.62 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  36.89 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  33.05 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  32.76 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.29 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  28.21 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  28.7 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  40.34 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  28.7 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  32.69 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.51 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  30.48 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  42.42 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  31.67 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  43.88 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  42.86 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  26.02 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  43.88 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  43.88 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  39.5 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  39.36 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  40.4 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  30.72 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  35.92 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  41.53 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  34.86 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  36.89 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  40.82 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  33.7 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  34.11 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  33.7 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  34.74 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  39.5 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  33.7 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  39 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  30.42 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  34.45 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  34.45 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  25.66 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  41.03 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.46 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  37.5 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  33.01 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  41.75 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  30.88 
 
 		 342 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  31.33 
 
 		 228 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  32.11 
 
 		 220 aa  62  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  28.77 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  33.03 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  32.61 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  38.66 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  30.48 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  36.17 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  33.62 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  33.69 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  27.75 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>