203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0395 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
218 aa  442  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  67.43 
 
 
221 aa  297  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  44.7 
 
 
218 aa  184  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  42.6 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  45.05 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  42.67 
 
 
223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  43.18 
 
 
223 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  40.36 
 
 
223 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  40.55 
 
 
224 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  40.54 
 
 
222 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  50.85 
 
 
216 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.22 
 
 
235 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  39.11 
 
 
235 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  31.82 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  36.72 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  41.4 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  35.6 
 
 
236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  40.38 
 
 
241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  37.74 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  34.09 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  34.09 
 
 
218 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  33.58 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.73 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.21 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.21 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  49.09 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.21 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  43.64 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  35.83 
 
 
142 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  30.94 
 
 
216 aa  86.3  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  42.06 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  43.64 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  38.53 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  32.26 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  28.81 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  35.24 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  34.56 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  29.74 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.19 
 
 
213 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  37.37 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  35.42 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  36.73 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  38.78 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  30.1 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  38.74 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  32.03 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  33.63 
 
 
400 aa  71.6  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  36.75 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  34.55 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  34.55 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  28.41 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  27.12 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  34.55 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  34.55 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  34.55 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  34.55 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  37.04 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  28.73 
 
 
216 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  37.04 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  39.62 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  26.91 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  31.18 
 
 
214 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  39.18 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  41.11 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  28.83 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  32.02 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  33.64 
 
 
241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  29.03 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  38.1 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  39.18 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  35.51 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  35.51 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  38.95 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  33.02 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  33.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  36 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  27.31 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  41.18 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  28.04 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  40.95 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  36.63 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  31.69 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  36.63 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  36.63 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  37 
 
 
233 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.21 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  34.34 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.93 
 
 
342 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  33.66 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
231 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>