177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05550 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  34.19 
 
 
231 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  34.19 
 
 
231 aa  99  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  34.19 
 
 
231 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  34.19 
 
 
231 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  36.67 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  28.09 
 
 
234 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  31.17 
 
 
241 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  26.99 
 
 
236 aa  88.2  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  37.84 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  34.19 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  26.38 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  34.19 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  26.38 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  33.76 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  33.76 
 
 
231 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  35.14 
 
 
231 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  38.93 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  36.49 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  28.09 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  28.57 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  28.19 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  31.14 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  25.53 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  25.53 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  25.53 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  25.53 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  25.53 
 
 
236 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  29.57 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  39.17 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  34.09 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.47 
 
 
230 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  27.68 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  27.68 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  30.4 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  42.86 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.43 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  34.76 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  41.18 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  27.66 
 
 
222 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  31.22 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  32.56 
 
 
218 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  40.37 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  36.72 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  36.72 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  31.94 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  35.53 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  37.6 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  37.79 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  30.84 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  37.1 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  29.84 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  32 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  31.72 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  40 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.95 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  35.29 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  46.51 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  36.29 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  32.18 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  28.04 
 
 
218 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  42.86 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  35.03 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  42.06 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  31.72 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  34.95 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  48.57 
 
 
222 aa  65.5  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  31.09 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  38 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  29.95 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  46.24 
 
 
316 aa  65.1  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  33.96 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  39.8 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  43.16 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30.41 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  30.57 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  34.68 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  35.05 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  24.68 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  29.03 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  46.48 
 
 
206 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  40.35 
 
 
174 aa  62  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  38.78 
 
 
228 aa  62  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  29.08 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.24 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  38.38 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>