175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0340 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0340  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  470  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  96.54 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  96.54 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  96.54 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  96.54 
 
 		 231 aa  454  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0257  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  434  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0361  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.43455  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0323  hypothetical protein  96.97 
 
 		 231 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0361  hypothetical protein  96.1 
 
 		 231 aa  432  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  68.4 
 
 		 231 aa  322  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  67.1 
 
 		 231 aa  318  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  63.04 
 
 		 235 aa  303  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  61.9 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  55.72 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  37.86 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  36.05 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  35.62 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  36.48 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  36.05 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  35.62 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  35.62 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  35.62 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  35.62 
 
 		 236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  35.19 
 
 		 236 aa  158  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  35.19 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  37.45 
 
 		 240 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  35.56 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  31.62 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.05 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  27.8 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  29.49 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  30.86 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  34.29 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  36.27 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  29.03 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  37.12 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.52 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  37.74 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.34 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  26.53 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  36.84 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  30.22 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  38.24 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.08 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  29.17 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  32.04 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  26.43 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  29.27 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  36.79 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  33.01 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  35.92 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  27.64 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.41 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  35.64 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  36 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.89 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  26.39 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  28.1 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  37.14 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  33.64 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  35.11 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  34.58 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  33.05 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.04 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.04 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  27.18 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  33.61 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  31.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  26.83 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  34.44 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  27.27 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  33 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  34.82 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  35.16 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  37.08 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  35.29 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  32.08 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  31.86 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  25.11 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  35.92 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  30.28 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.64 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  37.65 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  33.7 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  35.29 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  22.84 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>