167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3732 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 212 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  82.94 
 
 		 212 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  81.6 
 
 		 212 aa  330  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  81.13 
 
 		 212 aa  328  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  49.77 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  48.64 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  47.95 
 
 		 220 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  51.17 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  49.07 
 
 		 213 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  48.13 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  47.71 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  48.83 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  48.39 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  45.5 
 
 		 213 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  68.52 
 
 		 316 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  45.07 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  52.98 
 
 		 207 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  48.33 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  48.33 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  48.33 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  45 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  46.61 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  48.13 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  42.86 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  45.97 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  45.21 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  44.8 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  30.29 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  33.53 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  23.61 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  38.78 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  36.63 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.86 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  30.33 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  37.86 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  38.66 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  35.92 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  37.86 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.95 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  35.92 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  30.08 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  27.68 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  36.89 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  41.84 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  28.51 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  36.45 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  23.18 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  28.76 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  34.78 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  38.3 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  25.86 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  30.13 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.95 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.03 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  24.03 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30.4 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  24.1 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  24.58 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.98 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  28.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  28.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  34.91 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  28.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  23.39 
 
 		 229 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  28.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  28.72 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.65 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  24.58 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  30.23 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  29.17 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  27.01 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  34.55 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  34.34 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  41.94 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  34.91 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  24.66 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  22.75 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.88 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  28.04 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.15 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  26.23 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  33.02 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  33 
 
 		 375 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  28.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  35.05 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  22.73 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  28.03 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  30.3 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  35.58 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  34.78 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  35 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>