191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  426  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  50 
 
 
209 aa  182  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  52.91 
 
 
218 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  53.7 
 
 
204 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  50.22 
 
 
220 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  49.55 
 
 
214 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  47.22 
 
 
218 aa  165  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  51.14 
 
 
213 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  50.46 
 
 
206 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  46.08 
 
 
243 aa  157  9e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  46.82 
 
 
212 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  46.61 
 
 
212 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  54.44 
 
 
207 aa  154  8e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  45 
 
 
217 aa  153  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  46.12 
 
 
203 aa  147  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  47.3 
 
 
212 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  45.7 
 
 
213 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  46.85 
 
 
212 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  62.02 
 
 
316 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  48.89 
 
 
222 aa  141  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  45 
 
 
233 aa  137  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  44.44 
 
 
203 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  46.79 
 
 
203 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  45.54 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  45.74 
 
 
251 aa  100  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  36.65 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  30.63 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  29.13 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.13 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30.94 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.14 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  32.04 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  42.24 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  45.19 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  45.19 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  36.89 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  40.59 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  29.33 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  35.92 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  28.16 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  36.63 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  36.63 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  36.63 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  31.97 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  24.77 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  43.69 
 
 
244 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  38.68 
 
 
174 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  43.3 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  40.52 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  43.88 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  35.65 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  40.62 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  40.38 
 
 
205 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  37.62 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  36.36 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 
203 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  29.66 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.76 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  40.4 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  28.15 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  33.02 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  32.29 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  38.46 
 
 
209 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  26.63 
 
 
240 aa  58.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  39.18 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  30.47 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  30.54 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  38.3 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.54 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  26.72 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  36.45 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  37.5 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  38.61 
 
 
235 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  34.86 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  30.04 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  36.09 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  30.65 
 
 
189 aa  56.2  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  34.53 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  23.42 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  23.91 
 
 
227 aa  55.5  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  37.25 
 
 
220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  37.17 
 
 
168 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  41.67 
 
 
180 aa  55.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  30 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  23.94 
 
 
244 aa  55.5  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  38.54 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.08 
 
 
239 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  36.46 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  27.18 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>