144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2977 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  95.92 
 
 
196 aa  324  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  95.41 
 
 
196 aa  322  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  61.22 
 
 
196 aa  190  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  43.28 
 
 
208 aa  149  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  41.97 
 
 
193 aa  148  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  38.97 
 
 
194 aa  147  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  39.49 
 
 
195 aa  145  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  43.88 
 
 
189 aa  141  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  43.15 
 
 
189 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  44.16 
 
 
189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  41.97 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  43.37 
 
 
189 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  42.86 
 
 
189 aa  135  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  42.56 
 
 
189 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  42.56 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  41.84 
 
 
189 aa  131  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  41.12 
 
 
189 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  41.29 
 
 
189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  38.58 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  40.8 
 
 
189 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  40.8 
 
 
189 aa  128  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  45.08 
 
 
203 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  41.33 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  44.5 
 
 
189 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  38.92 
 
 
204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  37.44 
 
 
187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  38.31 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  38.31 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  34.18 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  36.32 
 
 
201 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  33.67 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  35.14 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  38.19 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  30.61 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  26.92 
 
 
229 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.58 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.38 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  41 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.45 
 
 
228 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  22.93 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  37.74 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  34.78 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  26.21 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  32.04 
 
 
219 aa  55.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  28.31 
 
 
212 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  35.29 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  31.16 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  28.31 
 
 
212 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  30.1 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  29.11 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  32.06 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  42.86 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  32.43 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  37.24 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  40.5 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 
239 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  36.63 
 
 
239 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  27.94 
 
 
204 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  40 
 
 
220 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  37.08 
 
 
183 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  27.75 
 
 
209 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  41.76 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  41.76 
 
 
220 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  37.25 
 
 
235 aa  51.2  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  36.54 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  33.86 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  31.31 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  35.19 
 
 
241 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  33.01 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  38.64 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  30.53 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  31.4 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  35.19 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
209 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  35.19 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  35.19 
 
 
241 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  35.19 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  36.26 
 
 
225 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  42.62 
 
 
183 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  35.19 
 
 
242 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  32.21 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  34.86 
 
 
254 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  40.66 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.62 
 
 
213 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  33 
 
 
224 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  37.8 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  39.64 
 
 
207 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  28.77 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  30.21 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  25 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  27.37 
 
 
197 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.27 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.7 
 
 
234 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  35.29 
 
 
241 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  42.53 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>