77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2647 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  88.56 
 
 		 201 aa  360  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  86.57 
 
 		 201 aa  354  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  73.98 
 
 		 201 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  50.77 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  49.48 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  48.48 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  37.17 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  32.32 
 
 		 195 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  31.12 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  29.35 
 
 		 195 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  31.09 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  33.83 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  34.5 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  31.12 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  34 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  32.65 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  29.23 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  31.63 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  29.38 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  31.34 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  31.12 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  30.61 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  29.59 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  30.61 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  39.68 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  29.08 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  28.06 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  30.46 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  28.14 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  28.25 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  27.46 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  31.48 
 
 		 216 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  33.94 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  26.91 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  27.04 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.52 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  36.7 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.16 
 
 		 226 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  29.55 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  29.3 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  28.24 
 
 		 244 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  32 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  31 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  32.32 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.27 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  27.35 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  27.44 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  34.04 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  31.58 
 
 		 174 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  27.31 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  27.71 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  27.71 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  33.66 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  28.68 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  32.29 
 
 		 234 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  30 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  30.3 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  30.1 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  28.36 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  29.36 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  28.64 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  32.98 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  28 
 
 		 235 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  24.29 
 
 		 215 aa  42  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.67 
 
 		 205 aa  42  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.71 
 
 		 218 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  25.12 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  26.53 
 
 		 380 aa  41.6  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  38.98 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  25.97 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>