161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4920 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
193 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  49.74 
 
 
193 aa  175  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  43.75 
 
 
195 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  41.36 
 
 
194 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  40.31 
 
 
195 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  41.97 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  39.9 
 
 
196 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  52.21 
 
 
196 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  38.38 
 
 
189 aa  124  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  37.81 
 
 
208 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  39.9 
 
 
196 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  37.63 
 
 
189 aa  122  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  41.03 
 
 
189 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  41.03 
 
 
189 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  41.03 
 
 
189 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.9 
 
 
204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  36.87 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  37.82 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  40.38 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  40.38 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  40.38 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  39.74 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  39.74 
 
 
189 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  38.46 
 
 
189 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  35.23 
 
 
203 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  39.1 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  29.84 
 
 
195 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  35.42 
 
 
187 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  29.32 
 
 
195 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  32.18 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  31.44 
 
 
201 aa  87  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  31.09 
 
 
201 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  30.93 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  32.16 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.06 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  36.04 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  34.86 
 
 
205 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  28.41 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  28.9 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  34.26 
 
 
229 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
209 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  27.53 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  30.37 
 
 
242 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  26.67 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.43 
 
 
342 aa  55.1  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  24.14 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  27.85 
 
 
210 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.69 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  35.23 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  26.53 
 
 
214 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  31.96 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  29.5 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  35.92 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  29.5 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  26.64 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  27.18 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  32.99 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  27.17 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  31.11 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  37.36 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  29.65 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  27.22 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  41.43 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 
400 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  23.53 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  29.91 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  32.74 
 
 
236 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  48.9  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  28.32 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  48.9  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  34.48 
 
 
218 aa  48.5  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  29.06 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  29.06 
 
 
230 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  35.23 
 
 
191 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 
239 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  22.92 
 
 
197 aa  48.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  34.07 
 
 
221 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  27.31 
 
 
243 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.06 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  34.04 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  32.35 
 
 
217 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  29.06 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  29.1 
 
 
185 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  29.91 
 
 
236 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 
241 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  31.78 
 
 
236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.91 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  32.95 
 
 
218 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  27.96 
 
 
234 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  27.57 
 
 
212 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>