78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5427 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  88.14 
 
 		 195 aa  344  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  52.82 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  51.28 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  50.77 
 
 		 201 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  50.88 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  52.58 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  43.67 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  29.32 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  33.85 
 
 		 196 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  33.51 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  33.16 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  27.46 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  26.94 
 
 		 204 aa  91.3  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  32.81 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  25.26 
 
 		 195 aa  88.6  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  26.8 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  27.08 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  26.87 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  26.73 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  32.73 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  25.64 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  25.4 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  25.26 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  26.04 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  23.96 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  24.1 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  23.59 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  25.52 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  23.59 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  24.74 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  28.46 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  23.96 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  25.63 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  42.27 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  28.91 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  29.5 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  34.38 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  26.51 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  26.79 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  32.74 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1692  hypothetical protein  28.95 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  29.31 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  29.73 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  31.91 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  29.66 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  35.23 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  33.65 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  33.03 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  31.51 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  23.9 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.29 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  28.64 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  28.86 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  34.69 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2668  protein of unknown function DUF162  32.14 
 
 		 168 aa  45.1  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  29.29 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  33.33 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  22.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  33.01 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  27.27 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  25.12 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  25.12 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  25.13 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  28.93 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  32.38 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  25.25 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  25.81 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  30.21 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  31.97 
 
 		 316 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  27.18 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  31.63 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  28.18 
 
 		 180 aa  41.2  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  30.21 
 
 		 235 aa  41.2  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  27.14 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>