94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1854 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  71.81 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  71.81 
 
 		 189 aa  274  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  72.87 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  71.28 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  72.34 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  71.28 
 
 		 189 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  70.21 
 
 		 189 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  72.34 
 
 		 189 aa  270  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  70.21 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  69.15 
 
 		 189 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  68.62 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  68.62 
 
 		 189 aa  262  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  67.02 
 
 		 189 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  53.72 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  43.83 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  34.21 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  33.82 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  35.96 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  51 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  34.87 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  34.87 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  49 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  35.08 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  32.99 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  28.65 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  25.4 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  29.53 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  26.7 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  29.02 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  30.32 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  26.67 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  27.46 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  37.17 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  31.15 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  28.68 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  28.68 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  28.68 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  26.02 
 
 		 201 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  31.67 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  34.43 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  35.29 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  29.84 
 
 		 224 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  28.74 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  38.81 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  30.51 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  38.81 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  32 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  38.81 
 
 		 239 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  33.66 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  27.45 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.08 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.87 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  27.83 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  30.3 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  23.3 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.12 
 
 		 243 aa  44.7  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  35.38 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  31.19 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  25.37 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  34.88 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  34.88 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  31.4 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  35.38 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  40.68 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  38 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  23.88 
 
 		 233 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  30.28 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  36.92 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  42.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  34.82 
 
 		 223 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  27.52 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  37.31 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 		 213 aa  42  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  62.07 
 
 		 226 aa  42  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  38.98 
 
 		 220 aa  42  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  38.98 
 
 		 382 aa  42  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  28.85 
 
 		 211 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  38.98 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  25.48 
 
 		 225 aa  42  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  37.29 
 
 		 220 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  37.29 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  32.14 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  37.29 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  40 
 
 		 189 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  29.67 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>