179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2595 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
213 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  55.16 
 
 
220 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  53.46 
 
 
218 aa  191  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  53.37 
 
 
203 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  53.95 
 
 
213 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  53.08 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  52.09 
 
 
218 aa  177  8e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  50.93 
 
 
212 aa  177  9e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  52.31 
 
 
212 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  52.31 
 
 
212 aa  175  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  55.49 
 
 
207 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  49.07 
 
 
212 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  48.83 
 
 
243 aa  168  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  75.7 
 
 
316 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  59.75 
 
 
203 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  59.75 
 
 
203 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  59.75 
 
 
203 aa  164  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  47.66 
 
 
217 aa  157  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  51.14 
 
 
219 aa  155  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  50.24 
 
 
204 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  50.46 
 
 
207 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  54.09 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  52.56 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  46.73 
 
 
233 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  43.5 
 
 
209 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  48.34 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  45.66 
 
 
251 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  32.42 
 
 
220 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  32.88 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  32.74 
 
 
228 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  30.94 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.29 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  31.58 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  32.2 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  24.77 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.98 
 
 
233 aa  65.1  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  43.16 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  29.86 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  35.61 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  25.23 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  42.7 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  32.58 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  33.55 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  39.42 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  31.58 
 
 
243 aa  62  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  36.36 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  34.31 
 
 
142 aa  61.6  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  38.46 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  32.16 
 
 
254 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  32.16 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  35.12 
 
 
194 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  37.38 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  40.38 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  37.38 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  25.41 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  38.46 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  24.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  24.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  24.86 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  33.9 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  24.86 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  24.86 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  36.36 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  38.04 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  28.93 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.02 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  26.34 
 
 
227 aa  58.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  28.03 
 
 
223 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  30.25 
 
 
235 aa  58.2  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  36.46 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  36.17 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  33.04 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  36.47 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  31 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  35.24 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  37.89 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.61 
 
 
342 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  32.14 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  37.61 
 
 
205 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  34.75 
 
 
189 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  29.46 
 
 
223 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  31.86 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  34.29 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  31.67 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  32.26 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  23.57 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  26.07 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  26.18 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>