194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2900 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 209 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  62.14 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  60.68 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  50 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  52.09 
 
 		 214 aa  168  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  45.5 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  47.71 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  47.25 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  45.29 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  46.26 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  45.62 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  45.62 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  46.79 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  47.96 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  65.45 
 
 		 316 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  43.95 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  42.08 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  39.46 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  47.34 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  47.34 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  47.34 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  49.04 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  43.72 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  47.25 
 
 		 207 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  46.61 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  41.94 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  42.41 
 
 		 251 aa  99.4  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  35.71 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  35.54 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  29.74 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  31.05 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  40.59 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.18 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  29.6 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  40 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  26.91 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  38.78 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  38.78 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  38.78 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  38.78 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  29.41 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  31.19 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  31.19 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  38.1 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  30.22 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  28.28 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  29.36 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  35.79 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  28.5 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  29.82 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  38.02 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.78 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.62 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  30.9 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  32.43 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30.04 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  24.42 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  26.99 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  37.19 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39.78 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2445  protein of unknown function DUF162  33.14 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.937091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  37.37 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  35.71 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  41.07 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0361  protein of unknown function DUF162  38.02 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  40.18 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  32.2 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  29.82 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  33.09 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  25.35 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  38.83 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  40.2 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  40.2 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  32.42 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.38 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  31.67 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  31.22 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  30 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  26.37 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  28 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  24.77 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  35.65 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  28.7 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  29.82 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  25.68 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  29.31 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  29.22 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  30.74 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  30.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  30.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  35.42 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  30.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  30.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  30.74 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>