156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1464 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
214 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  54.34 
 
 
203 aa  186  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  53.08 
 
 
213 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  52.09 
 
 
209 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  49.34 
 
 
204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  49.55 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  52.34 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  49.55 
 
 
219 aa  158  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  50.91 
 
 
206 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  53.51 
 
 
207 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  73.58 
 
 
316 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  45 
 
 
212 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  45.62 
 
 
212 aa  141  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  44.14 
 
 
212 aa  141  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  47.11 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  43.78 
 
 
243 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  43.69 
 
 
212 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  43.26 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  39.55 
 
 
213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  43.61 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  43.32 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  40 
 
 
207 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  43.93 
 
 
203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  43.72 
 
 
251 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  33.7 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  34.76 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  31.22 
 
 
235 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  31.18 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  34.92 
 
 
241 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  41.9 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  34.74 
 
 
236 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  32.75 
 
 
174 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  33.17 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  26.87 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  41.35 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  33.01 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  31.12 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  27.39 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  32.02 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  39.05 
 
 
142 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  34.23 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  33.61 
 
 
211 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  31.18 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  31.25 
 
 
225 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  26.2 
 
 
216 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  39.45 
 
 
226 aa  59.3  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  31.33 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  39.13 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.5 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  27.1 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  31.21 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  38.18 
 
 
222 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  29.07 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  29.13 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  25.33 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  25.38 
 
 
236 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  23.91 
 
 
236 aa  55.1  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  32.78 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.57 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  28.09 
 
 
216 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  24.87 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  23.91 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  23.91 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  23.91 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  36.89 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.67 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  29.2 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  23.91 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  29.2 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  36.11 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  23.21 
 
 
236 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  34 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.46 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  34 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2924  hypothetical protein  30.11 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0363657  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  24.87 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  29.07 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  37.11 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  23.64 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 
183 aa  52.4  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  27.06 
 
 
223 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  35.64 
 
 
235 aa  51.6  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  28.57 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  30.25 
 
 
209 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  23.18 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0153  hypothetical protein  35.29 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000024635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  27.24 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  24.59 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  23.18 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.38 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  34.55 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  28.42 
 
 
185 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  35.64 
 
 
231 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  37.21 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>