More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0432 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  706    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.36 
 
 
722 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  30.99 
 
 
400 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  33.63 
 
 
379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0485  hypothetical protein  35.29 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.964373 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  32.35 
 
 
382 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 
386 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  32.05 
 
 
375 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  34.63 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0277  hypothetical protein  31.78 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  28.49 
 
 
730 aa  163  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  30.89 
 
 
473 aa  162  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  30.12 
 
 
717 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  30.99 
 
 
712 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  27.78 
 
 
475 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  30.64 
 
 
463 aa  159  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  30.23 
 
 
458 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  31.16 
 
 
383 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  27.47 
 
 
473 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  31.95 
 
 
710 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  30.49 
 
 
482 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
477 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  30.49 
 
 
477 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  30.11 
 
 
477 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  26.48 
 
 
473 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  30.64 
 
 
717 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  30.49 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  30.22 
 
 
482 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  29.36 
 
 
472 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  28.8 
 
 
478 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0670  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.86 
 
 
480 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.88512  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  29.94 
 
 
490 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  28.65 
 
 
717 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  29.34 
 
 
476 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  30.68 
 
 
482 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  30.43 
 
 
475 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  27.15 
 
 
482 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1748  iron-sulfur cluster binding protein  25.48 
 
 
474 aa  149  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1612  putative iron-sulfur binding protein  31.51 
 
 
469 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  24.59 
 
 
475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  24.59 
 
 
475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  24.59 
 
 
475 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  29.85 
 
 
464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  30.97 
 
 
714 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  24.31 
 
 
475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  24.86 
 
 
475 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  29.63 
 
 
472 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  30.55 
 
 
716 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  24.31 
 
 
475 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  24.31 
 
 
475 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  24.31 
 
 
475 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  28.69 
 
 
489 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1463  hypothetical protein  30 
 
 
470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.57968  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  24.59 
 
 
475 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  29.33 
 
 
713 aa  146  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  29.13 
 
 
470 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  28.85 
 
 
470 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  28.2 
 
 
463 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  29.97 
 
 
711 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  25.35 
 
 
470 aa  145  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  27.83 
 
 
767 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1934  iron-sulfur cluster binding protein  30.55 
 
 
469 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.628498  normal  0.020498 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1606  protein of unknown function DUF162  30.55 
 
 
469 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143052  normal  0.308482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  28.95 
 
 
708 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  28.85 
 
 
470 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  28.85 
 
 
470 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1207  Iron-sulfur cluster binding protein  30.32 
 
 
470 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.112405 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  29.59 
 
 
456 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1311  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.35 
 
 
470 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2721  Iron-sulfur cluster binding protein  27.71 
 
 
471 aa  142  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535874  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  29.48 
 
 
712 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  27.88 
 
 
484 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2040  hypothetical protein  29.35 
 
 
470 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1140  hypothetical protein  29.35 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344454  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  26.81 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  28.7 
 
 
711 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2167  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.35 
 
 
470 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2147  hypothetical protein  29.03 
 
 
470 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.68355  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2584  protein of unknown function DUF162  28.71 
 
 
471 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31363  hitchhiker  0.000668194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5436  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.03 
 
 
470 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0384157  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5947  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.03 
 
 
470 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.127817  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  27.17 
 
 
481 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2130  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.03 
 
 
470 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350099  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  28.65 
 
 
741 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1548  putative iron-sulfur binding protein  28.39 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.360609  normal  0.0421236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  28.32 
 
 
738 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  27.75 
 
 
475 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  28.41 
 
 
711 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  27.17 
 
 
481 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  28.01 
 
 
481 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  28.57 
 
 
721 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  29.26 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1493  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.32 
 
 
483 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1712  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  30.32 
 
 
483 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2221  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.32 
 
 
483 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2659  iron-sulfur cluster binding protein  30.32 
 
 
483 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1871  iron-sulfur cluster binding protein  30.45 
 
 
522 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.287018  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2603  iron-sulfur cluster binding protein  30.32 
 
 
483 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255424  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3099  putative iron-sulfur cluster-binding protein  30.32 
 
 
536 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>