More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1225 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  771    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0485  hypothetical protein  82.45 
 
 		 382 aa  633  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.964373 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0277  hypothetical protein  77.93 
 
 		 391 aa  592  1e-168  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  75.86 
 
 		 380 aa  584  1e-166  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1348  hypothetical protein  72.68 
 
 		 386 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  63.93 
 
 		 382 aa  528  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  61.17 
 
 		 375 aa  482  1e-135  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  59.47 
 
 		 383 aa  478  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  43.28 
 
 		 400 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  45.01 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1217  iron-sulfur cluster binding protein  40.58 
 
 		 481 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.49103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3165  iron-sulfur cluster binding protein  41.42 
 
 		 475 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2281  iron-sulfur cluster binding protein  38.86 
 
 		 476 aa  245  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  37.43 
 
 		 722 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3588  iron-sulfur cluster binding protein  41.44 
 
 		 469 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3823  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.207305  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1095  iron-sulfur cluster binding protein  39.36 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0080  iron-sulfur cluster binding protein  37.43 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157943  unclonable  0.0000167452 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2183  iron-sulfur cluster-binding protein  40.54 
 
 		 477 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0459  iron-sulfur cluster-binding protein  40.54 
 
 		 477 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0868  iron-sulfur cluster-binding protein  40.54 
 
 		 477 aa  235  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.307451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  41.67 
 
 		 710 aa  235  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1430  iron-sulfur cluster binding protein  40.54 
 
 		 482 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.461528  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2925  iron-sulfur cluster binding protein  40.85 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.117393  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0556  iron-sulfur cluster binding protein  40.54 
 
 		 477 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1874  iron-sulfur cluster binding protein  40.27 
 
 		 482 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2079  iron-sulfur cluster binding protein  40.27 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3262  iron-sulfur cluster-binding protein  38 
 
 		 470 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2957  iron-sulfur cluster-binding protein  38.29 
 
 		 470 aa  229  7e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  36.36 
 
 		 717 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  37.37 
 
 		 711 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43090  iron-sulfur cluster binding protein-like protein  36.74 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3036  iron-sulfur cluster-binding protein  38 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3269  iron-sulfur cluster-binding protein  38 
 
 		 470 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1768  hypothetical protein  39.12 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.215438  normal  0.0554235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0559  hypothetical protein  38.94 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.907474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  36.57 
 
 		 714 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0751  Iron-sulfur cluster binding protein  36.41 
 
 		 484 aa  225  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2994  Iron-sulfur cluster binding protein  40.28 
 
 		 489 aa  225  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2430  protein of unknown function DUF162  38.66 
 
 		 481 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.182223 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0368  iron-sulfur cluster binding protein  36.29 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1019  ferrodoxin  37.13 
 
 		 456 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0199  Iron-sulfur cluster binding protein  36.16 
 
 		 477 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0817  iron-sulfur cluster binding protein  38.12 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.244426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2719  iron-sulfur cluster binding protein  37.05 
 
 		 473 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0362  protein of unknown function DUF162  37.7 
 
 		 738 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0710  hypothetical protein  35.19 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3879  protein of unknown function DUF162  35.25 
 
 		 741 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0271364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  36.87 
 
 		 708 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0716  iron-sulfur cluster binding protein  37.9 
 
 		 472 aa  218  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1764  Iron-sulfur cluster binding protein  36.06 
 
 		 480 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3605  Iron-sulfur cluster binding protein  37.11 
 
 		 472 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  35.45 
 
 		 712 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1716  iron-sulfur cluster binding protein  36.71 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0365  iron-sulfur cluster binding protein  38.2 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146775  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4688  iron-sulfur cluster-binding protein  35.56 
 
 		 492 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4816  iron-sulfur cluster binding protein  38.08 
 
 		 479 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0391  iron-sulfur cluster binding protein  36.72 
 
 		 475 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  35.19 
 
 		 711 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  36.06 
 
 		 712 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5446  Iron-sulfur cluster binding protein  36.36 
 
 		 481 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.776184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  36.34 
 
 		 717 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  35.65 
 
 		 717 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0811  iron-sulfur cluster binding protein  36.32 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.016821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1420  iron-sulfur cluster binding protein  35.14 
 
 		 486 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1691  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.91 
 
 		 479 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  35.67 
 
 		 711 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2897  hypothetical protein  36.65 
 
 		 473 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00038131  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00263  predicted amino acid dehydrogenase with NAD(P)-binding domain and ferridoxin-like domain  34.51 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3298  iron-sulfur cluster binding protein  34.51 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3315  iron-sulfur cluster binding protein  34.51 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2667  protein of unknown function DUF162  35.07 
 
 		 727 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00267  hypothetical protein  34.51 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4459  iron-sulfur cluster binding protein  35.98 
 
 		 470 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0360  iron-sulfur cluster binding protein  34.51 
 
 		 475 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.400129 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1273  iron-sulfur cluster binding protein  35.41 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3260  iron-sulfur cluster binding protein  35.29 
 
 		 480 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2594  protein of unknown function DUF162  37.57 
 
 		 475 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.487179  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0360  iron-sulfur cluster binding protein  34.24 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.53651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0322  iron-sulfur cluster binding protein  34.24 
 
 		 475 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2769  iron-sulfur cluster binding protein  37.01 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0339  iron-sulfur cluster binding protein  34.24 
 
 		 475 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5897  iron-sulfur cluster binding protein  35.51 
 
 		 481 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.566043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1233  iron-sulfur cluster binding protein  34.15 
 
 		 473 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.318042  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5376  iron-sulfur cluster binding protein  36.93 
 
 		 481 aa  209  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.75829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2678  iron-sulfur cluster binding protein  34.78 
 
 		 473 aa  209  9e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2446  protein of unknown function DUF162  34.36 
 
 		 812 aa  209  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.890609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1463  iron-sulfur cluster binding protein  37.63 
 
 		 485 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0261337  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1453  putative iron-sulfur cluster binding protein  31.64 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00604252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1376  iron-sulfur cluster binding protein  40.38 
 
 		 475 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0070  iron-sulfur cluster binding protein  33.05 
 
 		 479 aa  207  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0932  protein of unknown function DUF162  34.19 
 
 		 458 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2672  iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0258  iron-sulfur cluster binding protein  33.7 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  37.85 
 
 		 767 aa  206  4e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0111  iron-sulfur cluster binding protein  33.05 
 
 		 479 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0085  iron-sulfur cluster binding protein  32.77 
 
 		 479 aa  206  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6083  Iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 481 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.472054  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2805  iron-sulfur cluster binding protein  34.94 
 
 		 481 aa  206  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37070  (4Fe-4S) cluster-containing protein  38.87 
 
 		 475 aa  205  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621566  normal  0.014795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>