205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1844 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  44.7 
 
 
218 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  43.78 
 
 
221 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  45.73 
 
 
223 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  36.82 
 
 
223 aa  153  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  39.27 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  37.84 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  39.17 
 
 
223 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  37.73 
 
 
223 aa  142  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  36.87 
 
 
224 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  37.05 
 
 
222 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  34.56 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  49.53 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  48.6 
 
 
241 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  38.29 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  34.68 
 
 
235 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.52 
 
 
235 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  36.52 
 
 
236 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  30.05 
 
 
218 aa  89.4  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  30.05 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  29.58 
 
 
218 aa  87  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2910  protein of unknown function DUF162  38.94 
 
 
400 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000447072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  28.65 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  27.81 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  27.81 
 
 
230 aa  85.1  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  28.65 
 
 
230 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  28.96 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  26.29 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  27.88 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  30.64 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  39.62 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  38.24 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  30.52 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  35.24 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  35.96 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  30.6 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  32.8 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1429  hypothetical protein  34.91 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1875  hypothetical protein  34.91 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  30.85 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  40.82 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2184  hypothetical protein  34.91 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0557  hypothetical protein  34.91 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0869  hypothetical protein  34.91 
 
 
241 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.386872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  34.65 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1010  hypothetical protein  39.64 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.12516  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  31.05 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2078  hypothetical protein  34.91 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3084  protein of unknown function DUF162  29.05 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  36.46 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  28.95 
 
 
214 aa  72  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  40 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  31.22 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0984  protein of unknown function DUF162  35.14 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000554666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0460  hypothetical protein  33.96 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  30.09 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  38.05 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  31.43 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  28.51 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  29.39 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1094  protein of unknown function DUF162  38.46 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  35.48 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  29.02 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  34.55 
 
 
209 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1225  hypothetical protein  36.28 
 
 
379 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.229478 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  29.5 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  30.09 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1342  hypothetical protein  35.54 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.081676  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  30.63 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  33.65 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  37.86 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1728  protein of unknown function DUF162  29.91 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.488819  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  32.65 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  29.07 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  29.33 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2437  hypothetical protein  39.13 
 
 
194 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.281231  normal  0.501528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  31.25 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  30.74 
 
 
212 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0870  protein of unknown function DUF162  33.63 
 
 
383 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.117367  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.02 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1992  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  32.02 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  34.31 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  37.82 
 
 
316 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  35.05 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  32.32 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  34.02 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  34.07 
 
 
233 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  33 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1348  hypothetical protein  33.88 
 
 
386 aa  59.7  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  32.63 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  28.95 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  31.96 
 
 
224 aa  58.5  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  29.17 
 
 
183 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  31.19 
 
 
239 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>