132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3006 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  78.84 
 
 		 189 aa  315  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  308  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2738  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1518  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2816  hypothetical protein  77.25 
 
 		 189 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2811  hypothetical protein  76.72 
 
 		 189 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2908  hypothetical protein  76.72 
 
 		 189 aa  299  2e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1268  hypothetical protein  74.07 
 
 		 189 aa  290  7e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1373  hypothetical protein  73.54 
 
 		 189 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1350  hypothetical protein  73.54 
 
 		 189 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1336  hypothetical protein  73.02 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3011  protein of unknown function DUF162  73.02 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.014585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1854  hypothetical protein  67.02 
 
 		 187 aa  260  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360306  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2443  hypothetical protein  58.73 
 
 		 189 aa  207  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0429594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  43.37 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  38.42 
 
 		 208 aa  127  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  40.61 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  40.31 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  35.57 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3930  protein of unknown function DUF162  44.53 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4920  protein of unknown function DUF162  36.87 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0840479  normal  0.348092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  55.45 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2948  protein of unknown function DUF162  35.08 
 
 		 193 aa  111  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  36.18 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  41.32 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  34.72 
 
 		 204 aa  94.7  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2840  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.516916  normal  0.547198 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2617  hypothetical protein  29.85 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2647  protein of unknown function DUF162  28.06 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1271  protein of unknown function DUF162  26.09 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.51876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5819  hypothetical protein  28.93 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68053  normal  0.186475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5427  protein of unknown function DUF162  25.63 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  38.68 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1178  hypothetical protein  23.35 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392457  normal  0.790539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  27.23 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2928  hypothetical protein  26.13 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  34.75 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  29 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2306  hypothetical protein  30.36 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  31.19 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  34.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  31.46 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  31.63 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  31.25 
 
 		 342 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  26.32 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  33.71 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  32.61 
 
 		 229 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.33 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  33.71 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  35.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  32.97 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  34.62 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1032  protein of unknown function DUF162  29.81 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00153846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  32.04 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  36.36 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  28.29 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  31.82 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  34 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  32.58 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  24.4 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0689  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  32.35 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  31.37 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  24.59 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  38.24 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  31.46 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  26.7 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  31.46 
 
 		 243 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  30.39 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1356  ykgG family protein  31.91 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  30.39 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  30.39 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  26.23 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  31.46 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  30.34 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  29 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  37.78 
 
 		 240 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1218  ykgG family protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1198  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1317  ykgG family protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1220  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1394  ykgG family protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2255  protein of unknown function DUF162  23.16 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000220864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  31.58 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  28.57 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  24.07 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  32.22 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  31.46 
 
 		 254 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>