176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  57.21 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  57.21 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  57.21 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  51.38 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  54.34 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  54.76 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  53.37 
 
 		 213 aa  182  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  50.94 
 
 		 213 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  57.46 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  48.13 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  74.53 
 
 		 316 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  47.55 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  50.48 
 
 		 204 aa  158  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  47.66 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  47.2 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  47.2 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  49.28 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  44.23 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  51.67 
 
 		 206 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  46.79 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  44.55 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  46.12 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  41.94 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  43.78 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  44.09 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  42.44 
 
 		 203 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  32.13 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  31.31 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  32.57 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  40 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  32.48 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  32.16 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  26.11 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  33.48 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  29.33 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  28.18 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  26.34 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  41.76 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  37.14 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  30.14 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  29.44 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  24.31 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  28.51 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  38.26 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  24.51 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  29.69 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  29.63 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  24.51 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  38.46 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  32.2 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  31.67 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  31.67 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  31.67 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  41.03 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  37.96 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  27.18 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.25 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  27.12 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  39.13 
 
 		 235 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  33.96 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  37 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  33.56 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.41 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  35.96 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1698  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000721084  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  35.34 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  29.6 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  35.96 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  29.6 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0373  hypothetical protein  23.73 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0981  hypothetical protein  30.77 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  36.84 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  37.39 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  37.39 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  39.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  38.26 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1272  protein of unknown function DUF162  25.79 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  24.77 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.93 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.71 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0969  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  29.61 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3988  ykgG family protein  28.29 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  33.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  33.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  28.46 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  33.68 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>