165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1032 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  99.53 
 
 		 212 aa  401  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  100 
 
 		 212 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  85.31 
 
 		 212 aa  340  7e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  81.6 
 
 		 212 aa  332  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  48.83 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  52.31 
 
 		 213 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  49.54 
 
 		 207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  47.03 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  50.7 
 
 		 218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  47.49 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  45.91 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  47.66 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  48.39 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  45.07 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  45.91 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  68.27 
 
 		 316 aa  144  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  44.14 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  46.98 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  50.57 
 
 		 207 aa  135  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  46.41 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  46.41 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  46.41 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  46.85 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  47.75 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  42.92 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  46.45 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  44.09 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  39.18 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  33.19 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  35.82 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  39 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  28.88 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  28.1 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  29.13 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  36.63 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  29.39 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  36.89 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  36.79 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  23.14 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  28.38 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  28.81 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  37.86 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.1 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  39.42 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.1 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.1 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  30.1 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  37.86 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  25.64 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  36.7 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  24.89 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  33.94 
 
 		 342 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  26.09 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  34.58 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  33.93 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  33.93 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  28.06 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  35.92 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  32.67 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  37.21 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  33.96 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  37.5 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  25 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  23.89 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  42.42 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25.45 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  24.35 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  29.88 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  34.34 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  34.65 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  36.36 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  36.46 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  28.87 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  34.62 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  27.62 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.45 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  29.39 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  28.83 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3417  protein of unknown function DUF162  27.36 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  27.27 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  34 
 
 		 375 aa  48.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  32.98 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  31.68 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  31.68 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  34.15 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  31 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1458  ykgG family protein  28.57 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  25.21 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  32.69 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  33.65 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  31.68 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  31.68 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1418  ykgG family protein  27.62 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1196  hypothetical protein  27.62 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>